Après plusieurs tentatives pour trouver un siège dans la ville, les frères capucins ont réussi à s’installer en 1554 dans le bourg de Santa Croce, où les moniales de Sainte-Agathe et de Sainte-Cécile disposaient d’une grande maison pourvue de dépendances et d’un grand jardin potager.
Ils y ont fondé un couvent, idéal pour se préparer sérieusement aux études, en raison de la présence de la prestigieuse Université et de la taille de la ville. Immédiatement, des cours pour préparer les prédicateurs ont été organisés, et des cours de théologie morale, principalement destinés aux confesseurs, sont venus compléter les cours de dogme théologique. Les frères se sont également consacrés à l’assistance spirituelle à l’hôpital et dans les prisons.
Le père Leopold Mandić, originaire de Castelnuovo di Cattaro, a exercé son précieux travail de confesseur et de guide spirituel au couvent de Santa Croce. L’église des capucins a été gravement endommagée le 14 mai 1944 par un bombardement aérien des forces anglo-américaines, mais le couvent des frères est miraculeusement resté intact, selon la prophétie du père Léopold. La statue de la Vierge a été sauvée, ainsi que sa cellule confessionnelle, le lieu où Dieu avait montré sa miséricorde.
L’assiduité des fidèles, malgré la situation, n’a pas diminué : « Les gens viennent à nous comme avant et même plus qu’avant… Ils demandant qu’un frère capucin revienne faire du porte à porte pour faire la quête, mais dans ces moments-là, surtout pour dispenser une parole de foi, de confiance et d’encouragement ».
